不断演变的“暴发”定义

部门-农产品生产

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2018年4月18日

詹妮弗·麦肯迪尔联合新鲜农产品协会

德·安·戴维斯堂兄弟农场,真叶农场多金游戏安全与质量副总裁

晚餐大爆发的日子已经一去不复返了。在PulseNet之前的几天中,爆发不仅需要“大”来进行识别,而且通常用于检测的脉冲场凝胶电泳(PFGE)也有明显的局限性。如今,全基因组测序(WGS)正在以超越PFGE所能做的任何方式,彻底改变对食源性疾病的研究。但是,有了这项新技术,是否该更新我们对暴发的定义了?例如:

  1. 梅里亚姆-韦伯斯特(Merriam-Webster)将爆发定义为:“疾病发病率突然上升-麻疹爆发。”
  2. CDC的定义有所不同。它的网站指出,暴发是``在特定时期内在给定地区或特定人群中发生的疾病,伤害或其他健康状况病例多于预期的情况。通常,这些案例被假定为有共同原因或以某种方式相互关联。有时与流行病区别开来是局部性的,或者是不太可能引起公众恐慌的术语。”
  3. 加拿大公共卫生局(PHAC)将暴发定义为“一个事件,其中两个或两个以上的人在暴露于共同的源后遭受相似的疾病。暴发是通过实验室监视或时间或地理上异常的疾病增加来识别的。爆发是通过实验室和/或流行病学证据证实的。”

CDC和PHAC定义之间存在细微差别。然而,从历史上看,暴发的决定性因素包括吃普通食物,与多种疾病有关以及一段不同的时期。现在,WGS正在推迟我们如何描述爆发源(例如食物与共享设备,土地,水等)以及时间要素。甚至与多种疾病相关的时间跨度(甚至是地理范围)也比我们过去看到的要广泛得多。在什么时候我们偏离了我们通常所说的“爆发”的常规思维呢?

WGS的强大功能以及对爆发定义的挑战,是该技术能够长期识别疾病的能力。我们不再需要疾病的发生率“突然上升”。实际上,有一些使用WGS发现的长期存在问题的示例。此外,如果实际来源不是特定的多金游戏,则WGS可能会取消流行病学调查。

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这可以通过两种类型的“爆发”场景来说明:

  • 设施的环境污染。单核细胞增生李斯特菌和沙门氏菌等环境病原体可能会在生产环境中潜伏并污染多金游戏,导致疾病。它们可能难以根除,这意味着食物可能会在很长一段时间内受到污染。此外,由于这是设施问题,因此可能会污染多种食物。 WGS是否使我们从将暴发与特定食物联系起来,转向了可能是输送机,水,田地,收割箱,手提袋等的共同来源?如果WGS能够证明疾病与遗传有关,那么如果不同的人报告使用不同的产品,那么流行病学的作用将是什么?很有可能没有可追踪的可疑食物。正如PHAC爆发的定义所暗示的那样,仅实验室监视就足以将某事称为爆发。
  • “自然”重复污染。假设您是一个农民,其田地恰好位于候鸟所走的路径下方。每年,同样的鸟类会飞过来,在您的收成上零星地堆积。如果您种植的新鲜农产品缺少杀伤步骤,则可能有人(或两个,三个或更多人)患这种病。为了说明起见,假设一个人在2015年生病。第二年,另一个人生病。但由于是同一只鸟或一群羊,WGS显示出两种疾病之间的密切遗传关联。现在是否符合爆发的定义?尽管这是一个极端的例子,但WGS完全有可能(而且似乎有道理)能够检测到这种情况。

我们是说不应该调查与此类事件有关的疾病吗?绝对不!必须发现这些问题,以便避免其他疾病。此外,公共卫生机构应因认识到这些问题而获得荣誉。但是话语很重要,在过去,称其为爆发疫情引起了消费者的集中反应,旨在避免疾病。鉴于WGS有潜力发现仅偶尔导致疾病的长期存在的问题,消费者是否会像召回疲劳那样经历“爆发性疲劳”?呼叫关联案件爆发可能会减轻消费者采取行动的反应的紧迫性。

即使病例数保持在单位数字内,疫情仍持续数年(例如,Blue Bell在五年内报告了10例病例,CRF冷冻多金游戏在两年半内有9例,等等)代表了情况到目前为止,我们对爆发的经典定义可能还需要一个新术语。现在该重新考虑爆发的意义了。